Kad Yamaha 1998. gadā pieteica nākamā gada YZF-R6, mērķis nebija vienkārši samazināt lielā R1 izmērus. Jaunajam 600 cm³ modelim bija jābūt vieglam un veiklam motociklam, kura raksturu nosaka augstos apgriezienos strādājošs četrcilindru motors. Ražotāja sākotnējā specifikācijā norādīti 120 ZS pie 13 000 apgriezieniem minūtē.
Konstrukcijas otra puse bija šasija. Deltabox II alumīnija rāmī motors kalpoja arī kā nesošs elements; sausā masa bija norādīta 169 kg, bet riteņu bāze — 1380 mm. Īsā riteņu bāze un nelielā masa palīdzēja Yamaha uzsvērt veiklību, savukārt garā aizmugurējā svira bija paredzēta vilces saglabāšanai, izejot no līkuma.
Šie skaitļi raksturo tieši pirmās paaudzes modeli un sava laika ražotāja specifikāciju, nevis katru vēlāk ražoto R6. Tā vēsturiskā nozīme ir skaidra: 600 cm³ klasei Yamaha piedāvāja atsevišķu, uz sportisku vadāmību vērstu konstrukciju, nevis piekāpīgāku ceļa motociklu ar sporta apdari.