Когда в 1998 году Yamaha представила YZF-R6 следующего модельного года, речь шла не просто об уменьшенном R1. Мотоцикл класса 600 см³ задумывался лёгким и манёвренным, а характер ему придавал четырёхцилиндровый двигатель, рассчитанный на высокие обороты. В первоначальных характеристиках производитель указывал 120 л. с. при 13 000 об/мин.
Эту идею продолжало шасси. Двигатель служил силовым элементом алюминиевой рамы Deltabox II; заявленная сухая масса составляла 169 кг, а колёсная база — 1380 мм. Небольшая масса и короткая база работали на манёвренность, тогда как длинный задний маятник должен был помогать сохранять сцепление при разгоне из поворота.
Эти цифры относятся к первому поколению и заводским данным того времени, а не ко всем последующим R6. Историческая особенность модели — самостоятельная спортивная конструкция для класса 600 см³ вместо обычного дорожного мотоцикла в гоночном обтекателе.